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WIWAM植物表型成像系统发表植物表型组学文章列表
发表时间:2020-05-07 10:48:54点击:1464
WIWAM植物表型成像系统由比利时SMO公司与GHent大学VIB研究所研制生产,整合了LED植物只能培养、自动化控制系统、叶绿素荧光成像测量分析、植物热成像分析、植物近红外成像分析、植物高光谱分析、植物多光谱分析、植物CT断层扫描分析、自动条码识别管理、RGB真3D成像等多项先进技术,以较优化的方式实现大量植物样品以较优化的方式实现大量植物样品——从拟南芥、水稻、玉米到各种其它植物的生理生态与形态结构成像分析,用于高通量植物表型成像分析测量、植物胁迫响应成像分析测量、植物生长分析测量、生态毒理学研究、性状识别及植物生理生态分析研究等。
SMO是欧洲先进的机械设备制造与设计工程公司,是先进家将大规模自动化理念和工业零件和设备整合入植物成像系统的厂家,在机械自动化以及机械视觉成像领域拥有丰富的设计和实践经验,为欧洲先进客户提供机械设计解决方案,SMO公司将机械领域的先进理念带入了植物表型机器人领域,所采用的配件均为工业界广泛认可的高品质配件,耐受苛刻环境,另外表型设备领域的诸多自动化配件,均由SMO公司自主设计,因公司拥有较为强大的工程师团队,基于工业领域的丰富经验,可针对不同客户需求,一般2-3周就可以提供较复杂表型成像系统的解决方案。目前WIWAM植物表型平台分为WIWAM XY,WIWAM Line以及WIWAM Conveyor 3个系列。同时还可提供WIWAM Boxing柜式成像系统,也提供野外表型成像系统WIWAMFIELD设计方案。
WIWAM植物表型成像系统的优势
所有表型平台均为SMO工程部门自主设计、针对课题组的研究项目快速、准确提供技术方案,设备中诸多备件为自主生产和设计
公司软件设计团队针对具体项目提供有针对性的WIWAM定制软件
SMO和VIB自主开发PAPPA数据管理、视觉成像和分析软件,系统有效处理整个实验设计的大数据
PIPPA软件可安装在网络服务器上,网络中每个计算机均可操作
在PIPPA软件内,可集合整合外来分析数据和文本
易于获取数据库和原始图像数据
与客户自有IT技术设施进行整合
针队客户对表型设备运行环境了解欠缺的事实,提供表型设备生长室、室温建设交钥匙设计方案,实现环境参数。
专门技术人员维护设备、定期指导维护硬件
官方代理密沟通服务、提供支持反馈
自主电路设计、建筑内电柜设计、机械电缆布线以及PLC管理所有室内设计,将工业领域理念灌输到科研中
采用开放式框架设计,整合世面上的所有种类成像模块。
迄今为止,利用WIWAM植物表型成像系统已经发表了大量的先进文章,部分文章列表参见附件。
2019
Asaari MSM, Mertens S, Dhondt S, Inzé D, Wuyts N, Scheunders P (2019) Analysis of hyperspectral images for detection of drought stress and recovery in maize plants in a high-throughput phenotyping platform. Computers and Electronics in Agriculture 162: 749–758
Rosa NM la, Lin C-W, Kang YJ, Dhondt S, Gonzalez N, Inzé D, Falter‐Braun P (2019) Drought resistance is mediated by divergent strategies in closely related Brassicaceae. New Phytologist. doi: 10.1111/nph.15841
Woloszynska M, Gall SL, Neyt P, Boccardi TM, Grasser M, L�0�1ngst G, Aesaert S, Coussens G, Dhondt S, Slijke EVD, et al (2019) Histone 2B monoubiquitination complex integrates transcript elongation with RNA processing at circadian clock and flowering regulators. PNAS 116: 8060–8069
Njuguna E, Coussens G, Neyt P, Aesaert S, Storme V, Demuynck K, Vanhaeren H, Dhondt S, Haver YV, Paul L, et al (2019) Functional analysis of Arabidopsis and maize transgenic lines overexpressing the ADP-ribose/NADH pyrophosphohydrolase, AtNUDX7. Int J Dev Biol 63: 45–55
2018
Mohd Asaari MS, Mishra P, Mertens S, Dhondt S, Inzé D, Wuyts N, Scheunders P (2018) Close-range hyperspectral image analysis for the early detection of stress responses in individual plants in a high-throughput phenotyping platform. ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing 138: 121–138
Beltramino M, Ercoli MF, Debernardi JM, Goldy C, Rojas AML, Nota F, Alvarez ME, Vercruyssen L, Inzé D, Palatnik JF, et al (2018) Robust increase of leaf size by Arabidopsis thaliana GRF3 -like transcription factors under different growth conditions. Scientific Reports 8: 13447
2017
Coppens F, Wuyts N, Inzé D, Dhondt S (2017) Unlocking the potential of plant phenotyping data through integration and data-driven approaches. Current Opinion in Systems Biology 4: 58–63
Donné S, Luong H, Dhondt S, Wuyts N, Inzé D, Goossens B, Philips W (2017) Robust plane-based calibration for linear cameras. 2017 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP). Pp 36–40
Dubois M, Claeys H, Van den Broeck L, Inzé D (2017) Time of day determines Arabidopsis transcriptome and growth dynamics under mild drought. Plant, Cell & Environment 40: 180–189
Baute J, Polyn S, De Block J, Blomme J, Van Lijsebettens M, Inzé D (2017) F-Box Protein FBX92 Affects Leaf Size in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Physiol 58: 962–975
2016
Clauw P, Coppens F, Korte A, Herman D, Slabbinck B, Dhondt S, Daele TV, Milde LD, Vermeersch M, Maleux K, et al (2016) Leaf Growth Response to Mild Drought: Natural Variation in Arabidopsis Sheds Light on Trait Architecture. The Plant Cell 28: 2417–2434
Shahrimie MAM, Mishra P, Mertens S, Dhondt S, Wuyts N, Scheunders P (2016) Modeling effects of illumination and plant geometry on leaf reflectance spectra in close-range hyperspectral imaging. 2016 8th Workshop on Hyperspectral Image and Signal Processing: Evolution in Remote Sensing (WHISPERS). pp 1–4
2015
Clauw P, Coppens F, Beuf KD, Dhondt S, Daele TV, Maleux K, Storme V, Clement L, Gonzalez N, Inzé D (2015) Leaf Responses to Mild Drought Stress in Natural Variants of Arabidopsis. Plant Physiology 167: 800–816
2013
Dhondt S, Wuyts N, Inzé D (2013) Cell to whole-plant phenotyping: the best is yet to come. Trends in Plant Science 18: 428–439
2011
Skirycz A, Vandenbroucke K, Clauw P, Maleux K, De Meyer B, Dhondt S, Pucci A, Gonzalez N, Hoeberichts F, Tognetti VB, et al (2011) Survival and growth of Arabidopsis plants given limited water are not equal. Nat Biotech 29: 212–214